AktualnościAkcjeAgenci Claude od Anthropic znajdują system enzymatyczny podobny do CRISPR, ale nieznana jest jego funkcja

Agenci Claude od Anthropic znajdują system enzymatyczny podobny do CRISPR, ale nieznana jest jego funkcja

Autor: Cryptopolitan·

Najważniejsze informacje

  • •Agenci Claude odkryli system ART podczas 21,5-godzinnej autonomicznej kampanii obejmującej 949 sesji i około 215,6 miliona tokenów, zakończonej 19 raportami do weryfikacji przez ludzi.
  • •Każde locus ART łączy odwrotną transkryptazę z tablicą 3–21 krótkich powtórzeń DNA oraz sąsiednim genem o nieznanej funkcji, bez obecności genów Cas.
  • •Dane RNA z bakteriofaga Staphylococcus pokazują, że tablica jest transkrybowana na krótkie RNA stanowiące do 8% RNA faga 15 minut po zakażeniu, choć aktywność enzymu i ewentualna rola przewodnicza pozostają nieudowodnione.
  • •Wszystkie dziesięć powtórzeń identycznego wyszukiwania przeoczyło tablicę powtórzeń, więc odkrycie dotarło do weryfikatorów drogą, której żadne powtórzenie nie odtworzyło.
  • •Feng Zhang określił tablice powtórzeń RNA związane z odwrotnymi transkryptazami jako intrygujące i zasługujące na dalsze badania, a dyrektor generalny Dario Amodei zasugerował, że system może reprezentować nowy, wciąż nieweryfikowany mechanizm edycji genów.
Agenci Claude od Anthropic znajdują system enzymatyczny podobny do CRISPR, ale nieznana jest jego funkcja

Anthropic poinformował w środę, że jego agenci Claude wykryli po około 21 godzinach autonomicznego wyszukiwania niescharakteryzowany wcześniej system enzymatyczny w wirusowym DNA. System wykazuje wzorzec przypominający CRISPR, ale firma przyznaje, że nie wie jeszcze, do czego służy. To jeden z pierwszych wyników uzyskanych przez grupę biologii molekularnej utworzoną przez Anthropic wiosną 2026 roku.

Zespół nazwał odkrycie array-associated reverse transcriptases, w skrócie ART, zgodnie z ogłoszeniem Anthropic.

Dziesięć powtórzeń tego samego wyszukiwania przeoczyło tablicę powtórzeń

Bakterie zwalczają wirusy, wykorzystując odwrotne transkryptazy — enzymy przekształcające RNA w DNA. Obok enzymu znajdowało się to, co przykuło uwagę Claude'a: równo rozmieszczone ciągi powtórzeń DNA obok drugiego genu o nieznanej funkcji.

Układ trójelementowy przypomina CRISPR, który przechowuje bibliotekę przewodników RNA w tablicy — bakteryjny mechanizm obronny, który badacze zaadaptowali później do powszechnie używanych narzędzi do edycji genomu. Każda tablica ART zawiera od 3 do 21 kopii krótkiego powtórzenia, a w pobliżu żadnego locus ART nie znajdują się geny Cas, jak podaje preprint.\nPublicznie dostępne dane RNA z bakteriofaga Staphylococcus pokazują, że tablica jest transkrybowana na odrębne krótkie RNA, które stanowią do 8% RNA faga 15 minut po zakażeniu. Czy te RNA pełnią rolę przewodników podobnie jak w CRISPR, pozostaje nierozstrzygnięte, a preprint zaznacza, że zespół nie wykazał, by enzym był aktywny lub działał na te RNA.

Anthropic dał agentom wytyczne: przeszukaj 1,9 miliarda klastrów białek w poszukiwaniu nowych systemów odwrotnych transkryptaz. Każde zadanie było planowane i wykonywane przez jednego agenta-pracownika i weryfikowane przez agenta-nadzorcę. W miarę gromadzenia ustaleń nadzorcy otwierali nowe zadania.

Kampania trwała 21,5 godziny bez udziału człowieka, jak podaje preprint, w ramach 949 sesji agentów i 215,6 miliona tokenów. Post Anthropic zaokrągla te liczby do około 950 agentów i 210 milionów tokenów. Agenci zgromadzili około 200 000 klastrów enzymów i ocenili 3564 potencjalne rodziny partnerów, a kampania zakończyła się 19 raportami przekazanymi do weryfikacji przez ludzi.

ART pojawił się niemal przypadkiem. Agent czytający surowe DNA obok osobliwego enzymu napisał, że widzi wzorzec powtórzeń „na oko”, a następnie policzył powtórzenia i zweryfikował je z literaturą, zanim opisał odkrycie.

Anthropic powtórzył tę samą kampanię jeszcze dziesięć razy. Każde powtórzenie przeoczyło tablicę, a żadne nie odczytało DNA położonego przed enzymem. Gdy agentom podano DNA bezpośrednio, najlepsze modele opisały tablicę w co najmniej 90% prób, ale po dodaniu narzędzi i plików wskaźnik spadł do zaledwie 32%. Odkrycie dotarło więc do ludzkich weryfikatorów drogą, której żadne z powtórzeń nie odtworzyło.

Feng Zhang popiera dalsze badania, a Kevin Blake wątpi w zastosowanie terapeutyczne

Feng Zhang, pionier CRISPR z MIT i Broad Institute, zapoznał się z preprintem. Nazwał identyfikację tablic powtórzeń RNA związanych z odwrotnymi transkryptazami „rzeczywiście intrygującą”, dodając, że „zasługuje na dalsze badania”.

Na platformie X dyrektor generalny Dario Amodei poszedł o krok dalej. Sugestia, że „maszyna molekularna” może „reprezentować nowy mechanizm edycji genów”, jest spójna z jego przekonaniem, że AI potrafi skompresować dekady postępu biologicznego do lat. Ta możliwość pozostaje nieweryfikowana, dopóki funkcja ART jest nieznana.

ART powstał laboratorium w Zatoce San Francisco, które Anthropic dopiero niedawno upublicznił. Firma zapewnia, że obiekt działa na poziomach bezpieczeństwa biologicznego 1 i 2, nie obchodzi się z patogenami zakażającymi ludzi, a wszelkie prace laboratoryjne pozostawia naukowcom. Jak relacjonowało Cryptopolitan w momencie potwierdzenia istnienia mokrego laboratorium, testuje się, czy Claude może pomagać w kierowaniu eksperymentami.

W kwietniu Anthropic kupił startup Coefficient Bio za około 400 milionów dolarów. Tego samego miesiąca OpenAI wypuściło własny model nauk o życiu, GPT-Rosalind.

Anthropic twierdzi, że eksperymenty mające ustalić funkcję ART są już w toku i zaprasza innych naukowców do składania propozycji badawczych. Pytania przed tymi działaniami to te, które preprint pozostawia otwarte: czy enzym jest aktywny i czy działa na krótkie RNA tablicy.

Źródło: Cryptopolitan