AnthropicのClaudeエージェント、CRISPR様酵素システムを発見も、その機能は依然不明
重要ポイント
- •Claudeエージェントは、949のセッションと約2億1560万トークンに及ぶ21.5時間の自律的キャンペーンでARTシステムを発見し、人間によるレビュー対象の19報告で終了した。
- •各ART遺伝子座は、逆転写酵素と3〜21コピーの短いDNA繰り返し配列のアレイ、および機能不明の近傍遺伝子を組み合わせており、Cas遺伝子は存在しない。
- •StaphylococcusファージのRNAデータから、アレイが感染15分後にファージRNAの最大8%を占める短鎖RNAへ転写されていることが示されたが、酵素の活性やガイド役についての役割は未実証である。
- •同一探索の10回の再実行はすべて繰り返し配列アレイを見逃したため、この発見はどの再実行も再現しなかった経路で人間のレビュアーに届いた。
- •Feng Zhang氏は逆転写酵素に結びついたRNA繰り返しアレイを興味深くさらなる調査に値すると評価し、CEOのDario Amodei氏はこのシステムが新しく未検証の遺伝子編集メカニズムを表す可能性があると示唆した。
Anthropicは水曜日、同社のClaudeエージェントが約21時間の自律的探索の末、ウイルスDNA内でこれまで特徴づけられていなかった酵素システムを検出したと発表した。このシステムはCRISPR様のパターンを持つが、同社はその機能についてはまだ分かっていないと述べている。これは、Anthropicが2026年春に設立した分子生物学グループによる最初の成果の一つである。
Anthropicの発表によると、チームはこの発見を「ART(array-associated reverse transcriptases:アレイ関連逆転写酵素)」と命名した。
同一探索の10回の再実行はすべて繰り返し配列アレイを見逃した
細菌は、RNAをDNAに変換する逆転写酵素を用いてウイルスと戦う。その酵素の隣には、Claudeの目を引いたものがあった。機能不明の第二の遺伝子の隣に、等間隔に並ぶ繰り返しDNA配列である。
この三要素の構成は、RNAガイドのライブラリをアレイとして保存するCRISPRを彷彿とさせる。CRISPRは、研究者がその後広く使われるゲノム編集ツールへと応用した細菌の防御機構である。プレプリントによると、各ARTアレイには短い繰り返し配列が3〜21コピー含まれ、ART遺伝子座の近くにはCas遺伝子は存在しない。
Staphylococcusファージの公開RNAデータから、このアレイが明確な短鎖RNAへと転写されていることが示された。これらは感染15分後にはファージRNAの最大8%を占めていた。これらのRNAがCRISPRのようにイド役を果たすかどうかは未解明であり、プレプリントは、酵素が活性を持つこと、またそれらのRNAに作用することのいずれもチームが実証していないと記している。
Anthropicはエージェントに新たな逆転写酵素システムを探して19億のタンパク質クラスタを調べるという指示を与えた。各タスクは1つのワーカーエージェントが計画・実行し、スーパーバイザーエージェントがレビューした。知見が蓄積されるにつれ、スーパーバイザーが新たなタスクを開設した。
プレプリントによると、このキャンペーンは人間の介入なしに21.5時間実行され、949のエージェントセッションと2億1560万トークンを消費した。Anthropicの投稿ではこれらの数値は約950エージェント、約2億1000万トークンと丸められている。エージェントは約20万の酵素クラスタを収集し、3564の候補パートナーファミリーをスコアリングし、キャンペーンは人間によるレビュー対象の19報告で締めくくられた。
ARTはほぼ偶然に発見された。特殊な酵素の隣の生のDNAを読んでいたエージェントは、繰り返しパターンを「目視で」確認できると記録し、繰り返し配列を数えて文献と照合した後、発見を報告書にまとめた。
Anthropicは同一のキャンペーンをさらに10回繰り返した。すべての再実行がアレイを見逃し、どの再実行も酵素の上流のDNAを読まなかった。DNAを直接与えられた場合、最も優れたモデルは最低90%の試行でアレイを記述できたが、ツールとファイルが加わると、その割合は最低32%まで低下した。そのため、この発見は、どの再実行も再現しなかった経路を通じて人間のレビュアーに届いた。
Feng Zhang氏はさらなる研究を支持、Kevin Blake氏は治療応用に懐疑
MITおよびBroad研究所のCRISPRの先駆者であるFeng Zhang氏はこのプレプリントをレビューした。同氏は、逆転写酵素に結びついたRNA繰り返しアレイの同定について「本当に興味深い」と評し、「さらなる調査に値する」と述べた。
X上で、CEOのDario Amodei氏はさらに踏み込んだ。AIが生物学的進歩の数十年を数年に圧縮できるという自身の賭けに沿って、この「分子機械」は「新しい遺伝子編集メカニズムを表す」可能性があると示唆した。ARTの機能が不明である今、その可能性は未検証のままである。
ARTは、Anthropicが最近公表したばかりのベイエリアのラボから生まれた。同社は、この施設はバイオセーフティーレベル1および2で運用され、ヒトに感染する病原体を扱わず、すべての実験作業は人間の科学者に委ねられていると述べている。Cryptopolitanがウェットラボの確認時に報じたように、同施設はClaudeが実験の指揮を支援できるかを検証している。
4月、AnthropicはスタートアップのCoefficient Bioを約4億ドルで買収した。同じ月、OpenAIは独自のライフサイエンスモデルGPT-Rosalindをリリースした。
Anthropicは、ARTの機能を解明する実験がすでに進行中であると述べ、他の研究者にも研究提案の提出を呼びかけている。これらの取り組みの前にある問いは、プレプリントが未解決のまま残したもの、すなわち酵素が活性を持つか、そしてアレイの短鎖RNAに作用するかである。
